윤 후보는 추경 처리 문제를 언급하며 문재인 정부의 방역 정책을 지적하고 나섰다. 윤 후보는 "민주당이 재산권 보상을 거론하지 않다가, 최근에서야 선거를 앞두고 손실 보상하겠다고 했다"라며 "이재명 후보도 선거 이후에 코로나19 대응이 확 바뀐다고 선언했다. 그동안 방관하다가 여당 후보로서 집권 정부의 방역 정책 실패를 인정하는데, 그렇다면 민주당이 책임 져야하는 것 아닌가"라고 이 후보를 공격했다.
그러자 이 후보는 "문재인 정부의 방역이 상당한 성과를 낸 것은 부인할 수 없다"라며 "(대한민국이) 치명률과 사망률이 제일 낮았고, 감염자도 제일 적었고 경제 회복률도 제일 높았다"라고 반박했다.
이어 "윤 후보는 마스크를 잘 안 쓰시죠? 부인도 잘 안 쓰시고, 규칙도 안 지키신다"라며 "또 신천지 (집단 감염으로) 대구에서 사람이 죽어 나갈 때 납득하기 어려운 이유로 압수수색 안 하지 않았는가? 국가 방역에 가장 비협조적인 분이 방역 성과를 지적하는 것은 맞지 않다"라고 비판했다. 윤 후보는 앞서 지역 유세를 다니며 수차례 마스크를 쓰지 않은 상태로 연설해 비판을 받았다.
윤 후보가 '이재명 후보도 문재인 정부의 실패를 인정하고, 방역 정책을 확 바꾸려는 것 아닌가'라고 지적한 것에 이 후보는 "지금 코로나19는 빨라지고, 치명률이 낮은 존재가 됐기 때문에 방역체계를 바꿔야 한다"라며 "보로 홍수를 못 막는 것처럼, 새로운 것을 찾아야 한다. 유연하게 스마트하게 바꾸자는 것이다"라고 반박했다. 또 "문재인 정부가 잘한 것은 승계하고, 부족한 것은 고치고, 필요한 것은 더 하자는 것"이라며 "국민의힘도 방해 좀 하지 말고 협조 좀 해달라"라고 맞섰다.