정부는 특히 이번 방위백서를 포함해 일본 정부가 최근 독도에 대한 부당한 주장을 강화하고 있는 점을 지적하고 강한 유감을 표명했다.
이는 일본 측이 도쿄 올림픽 조직위원회의 독도 표기 문제로 한국 내 반감을 불러일으킨데 이어 또다시 국내 여론을 자극한 것을 염두에 둔 것이다.정부는 "일본 정부의 부당한 주장이 대한민국 고유 영토인 독도에 대한 우리 주권에 어떠한 영향도 미치지 못한다는 것을 재차 분명히 하며, 독도에 대한 어떠한 도발에 대해서도 엄중하고 단호하게 대응해 나갈 것임을 밝히는 바"라고 말했다.
일본 측의 잇단 도발적 행태로 '올림픽 보이콧' 주장까지 나오는 가운데, 최근 한일 간 협의가 진행 중인 문재인 대통령의 일본 방문도 부정적 영향을 받을 가능성이 커졌다.