대검찰청은 9일 “수사지휘권 박탈은 형성적 처분으로서 쟁송절차에 의해 취소되지 않는한 지휘권 상실이라는 상태가 발생”한다며 “결과적으로 서울중앙지검이 자체 수사하게 되며 이런 사실을 중앙지검에 통보했다”고 밝혔다.
특히 윤석열 총장이 지난 2013년 국정원 댓글 사건 수사팀장의 직무배제를 당하고 수사지휘에서 손을 뗄 수 밖에 없었다는 점을 상기시켰다.
또 지휘권 발동 이후 법무부가 서울고검장을 본부장으로 하는 독립 수사본부 설치 제안을 해 이를 전폭 수용하였으며 법무부로부터 공개 건의해 달라는 요청을 받았다고 설명했다.
윤 총장은 전날 저녁 '독립적 수사본부'를 구성해 검찰총장의 수사지휘를 받지 않고 수사결과만 보고하는 방식을 추미애 법무부 장관에게 정식 건의했지만 곧바로 거절당했다.