NCCK는 "총리 후보 지명자의 이런 발언은 민족의 역사를 부인하고 왜곡하고 폄하하는 것"이라며 "이런 역사관을 가진 사람이 총리가 된다면 또 하나의 국가적 재앙이 될 것"이라고 말했다.
또 "무엇보다 심각한 것은 후보자 개인의 발언이 아니라 그런 무자격자를 후보자로 지명한 인사시스템"이라며 "제대로 된 검증 절차 없이 후보자를 지명한 것에 심각한 우려를 표한다"고 밝혔다.
한국교회연합(한교연)은 "문창극 후보자의 강연은 일부 표현의 미숙함이 있었고 개인적 역사관에 다 동의할 수 없다"면서도 "불행한 근대사를 극복하고 하나님의 주권적 역사 섭리 안에서 오늘의 발전을 이뤘다는 것을 신앙인의 관점에서 밝힌 것으로 이해해야 한다"고 주장했다.
한교연은 "성경적, 신학적 관점에서 문제가 될 수 없으며, 전체 맥락을 살피지 않고 문제삼는 마녀사냥식 몰이를 중단할 것을 촉구한다"고 말했다.